-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Default.aspx
1241 lines (1147 loc) · 66.5 KB
/
Default.aspx
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
<%--<%@ Page Title="Home Page" Language="C#" MasterPageFile="~/Site.Master" AutoEventWireup="true" CodeBehind="Default.aspx.cs" Inherits="Gff3_tools._Default" %>--%>
<%@ Page
Title="Gff3 Tools"
Language="C#"
MasterPageFile="~/Site.Master"
AutoEventWireup="true"
CodeBehind="Default.aspx.cs"
Inherits="Gff3_tools._Default"
ValidateRequest="false"
ViewStateEncryptionMode="Never" %>
<asp:Content ID="BodyContent" ContentPlaceHolderID="MainContent" runat="server" CssClass="container-lg">
<style>
.container {
margin-top: 20px;
}
td {
min-width: 70px;
}
p {
font-weight: lighter;
}
.animated {
-webkit-transition: height 0.2s;
-moz-transition: height 0.2s;
transition: height 0.2s;
}
.textbox {
width: 300px;
}
.stato {
text-align: center;
padding: 15px;
}
.ele-contiene-list .list-group-item, .ele-noncontiene-list .list-group-item {
clear: both;
padding: 0;
}
.ele-contiene-list .list-group-item span, .ele-noncontiene-list .list-group-item span {
display: inline-block;
padding: 8px;
}
.ele-contiene-list button, .ele-noncontiene-list button {
float: right;
margin: 2px;
}
.ele-contiene .input-group input[type="text"], .ele-noncontiene .input-group input[type="text"] {
width: 1%;
padding: 0.375rem 0.75rem;
margin: 0;
border-right: 0;
}
.ele-contiene .input-group button, .ele-noncontiene .input-group button {
margin: 0;
padding: 0.375rem 0.75rem;
}
.StickyHeader th {
position: sticky;
top: 60px;
background-color: #14989d;
}
.Footer {
background-color: #14989d;
}
#btnCarica {
margin-top: 10px;
}
/* .table a {
color: white;
}*/
.btn-operazioni {
max-width: 120px;
display: flex;
}
.card {
-webkit-box-shadow: 0px 0px 6px 0px #000000;
box-shadow: 0px 0px 6px 0px #000000;
}
#btn-back-to-top {
position: fixed;
bottom: 20px;
right: 20px;
display: none;
}
.popover {
max-width: 75%; /* Max Width of the popover (depending on the container!) */
}
#gdvBiocoso a {
color: white;
}
#gdvBiocoso > tbody > tr:not(.Footer) {
cursor: pointer;
}
.Footer td span {
border: 1px solid black;
padding: 0 8px;
}
.Footer td a {
padding: 0 8px;
}
.Footer td a:hover {
border: 1px solid white;
}
</style>
<div class="container">
<asp:Literal ID="messaggio" runat="server"></asp:Literal>
<div>
<div class="row">
<div class="col-md-8">
<h1><i class="fa-solid fa-dna"></i>Gff3 Tools</h1>
<h2>Strumenti per lo studio di file in formato .gff3</h2>
</div>
<div class="col-md-4 text-end">
<p class="fst-normal mb-0"><strong>Creato da:</strong> Cappelletti Daris <i class="fa-solid fa-user-secret"></i></p>
<p class="fst-normal"><strong>Collaboratrice:</strong> Cavalletti Elena <i class="fa-solid fa-user-graduate"></i></p>
</div>
</div>
<div class="accordion mb-3" id="accordionDettagli">
<div class="accordion-item">
<h2 class="accordion-header" id="headingThree">
<button class="accordion-button collapsed" type="button" data-bs-toggle="collapse" data-bs-target="#collapseThree" aria-expanded="false" aria-controls="collapseThree">
Funzionalità disponibili
</button>
</h2>
<div id="collapseThree" class="accordion-collapse collapse" aria-labelledby="headingThree" data-bs-parent="#accordionDettagli">
<div class="accordion-body">
<div style="font-size: small;">È possibile effettuare le seguenti operazioni: </div>
<ul style="font-size: small;">
<li>caricare e visualizzare uno o più file in formato .gff3
</li>
<li>Filtrare la lista impostando parole da ricercare/escludere
</li>
<li>Mostrare/Nascondere le colonne della tabella
</li>
<li>Esportare la tabella in formato excel
</li>
<li>Ordinare la tabella in ordine crescente/decrescente (cliccare sul nome della colonna)
</li>
<li>Impostare il numero di risultati da visualizzare
</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
</div>
<asp:Panel ID="panRicerca" runat="server" DefaultButton="btnRicerca">
<!-- Card caricamento files -->
<div class="card p-3 mb-3">
<h5 class="card-title">
<i class="fa-solid fa-file-arrow-up"></i>
File
</h5>
<p class="card-text">
Seleziona uno o più file in formato .gff3 e clicca sul pulsante carica. I risultati verranno mostrati in un'unica tabella.<br />
NB: Se il file è rinominato con il nome del campione verrà ricercato su Imicrobe
per estrapolare informazioni aggiuntive e permettere la visione dei download collegati.<br />
(esempio: MMETSP0013.gff3)
</p>
<div class="card-body">
<h6>Carica i file GFF3</h6>
<div class="row">
<div class="col-md-5">
<asp:FileUpload ID="fileCaricato" runat="server" CssClass="form-control" AllowMultiple="true" accept=".gff3" />
<asp:Button
ID="btnCarica"
runat="server"
ClientIDMode="Static"
Text="Carica file"
CssClass="btn btn-secondary"
OnClick="ImportGff3Files"
OnClientClick="showLoading();" />
</div>
<div class="col-md-7">
<asp:Repeater ID="repBtnModalFile" runat="server">
<ItemTemplate>
<div class="row">
<div class="col-md-3 fw-bold">
File attivo:
</div>
<div class="col-md-9">
<button
type="button"
<%#
(
Eval("sample_id") == null || (int)Eval("sample_id") != 0
? $"class=\"btn btn-primary\" data-bs-toggle=\"modal\" data-bs-target=\"#samplemodal-{Eval("sample_id")}\""
: "class=\"btn btn-secondary\""
)
%>>
<%# Eval("sample_description") %> (<%# Eval("sample_name") %>)
</button>
</div>
<div class="modal fade" id="samplemodal-<%# Eval("sample_id") %>" tabindex="-1" aria-labelledby="labelModal-<%# Eval("sample_id") %>" aria-hidden="true">
<div class="modal-dialog modal-xl">
<div class="modal-content">
<div class="modal-header">
<h5 class="modal-title" id="labelModal-<%# Eval("sample_id") %>">
<%# Eval("sample_description") %>
<span class="badge rounded-pill bg-warning text-dark">
<%# Eval("sample_type") %>
</span>
</h5>
<button type="button" class="btn-close" data-bs-dismiss="modal" aria-label="Close"></button>
</div>
<div class="modal-body">
<div class="row">
<div class="col-md-4 fw-bold">
Campione
</div>
<div class="col-md-8">
<%# Eval("sample_name") %>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-4 fw-bold">
Ricercatori
</div>
<div class="col-md-8">
<asp:Repeater runat="server" DataSource='<%# Eval("investigators") %>'>
<ItemTemplate>
<%# Eval("investigator_name") %>
</ItemTemplate>
</asp:Repeater>
</div>
</div>
<div class="accordion mt-5" id="accordion-<%# Eval("sample_id") %>">
<!-- files -->
<asp:Repeater runat="server" DataSource='<%# Eval("sample_files") %>'>
<HeaderTemplate>
<div class="accordion-item">
<h2 class="accordion-header" id="headingFiles">
<button class="accordion-button collapsed" type="button" data-bs-toggle="collapse" data-bs-target="#collapseFiles" aria-expanded="true" aria-controls="headingCollapseFiles">
Files
</button>
</h2>
<div id="collapseFiles" class="accordion-collapse collapse" aria-labelledby="headingCollapseFiles"
data-bs-parent="#accordion-<%# DataBinder.Eval(((RepeaterItem)Container.Parent.Parent).DataItem, "sample_id")%>">
<div class="accordion-body">
<table class="table">
<thead>
<tr>
<th scope="col">Nome</th>
<th scope="col">Tipo</th>
<th scope="col"></th>
</tr>
</thead>
<tbody>
</HeaderTemplate>
<ItemTemplate>
<tr>
<td><%# GetFileName(Eval("file")) %></td>
<td><%# Eval("sample_file_type.type") %></td>
<td><a target="_blank" class="btn btn-outline-secondary" href="http://datacommons.cyverse.org/browse/<%# Eval("file") %>">Download</a></td>
</tr>
</ItemTemplate>
<FooterTemplate>
</tbody>
</table>
</div>
</div>
</div>
</FooterTemplate>
</asp:Repeater>
<!-- Attributes -->
<asp:Repeater runat="server" DataSource='<%# Eval("sample_attrs") %>'>
<HeaderTemplate>
<div class="accordion-item">
<h2 class="accordion-header" id="headingAttributes">
<button class="accordion-button collapsed" type="button" data-bs-toggle="collapse" data-bs-target="#collapseAttributes" aria-expanded="true" aria-controls="headingCollapseAttributes">
Attributi
</button>
</h2>
<div id="collapseAttributes" class="accordion-collapse collapse" aria-labelledby="headingCollapseAttributes"
data-bs-parent="#accordion-<%# DataBinder.Eval(((RepeaterItem)Container.Parent.Parent).DataItem, "sample_id")%>">
<div class="accordion-body">
<table class="table" style="table-layout: fixed;">
<thead>
<tr>
<th scope="col">Tipo</th>
<th scope="col">Valore</th>
</tr>
</thead>
<tbody>
</HeaderTemplate>
<ItemTemplate>
<tr>
<td><%# Eval("sample_attr_type.sample_attr_type_category.category") %></td>
<td>
<div style="word-wrap: break-word; overflow-wrap: break-word; width: 100%;">
<%# Eval("attr_value") %>
</div>
</td>
</tr>
</ItemTemplate>
<FooterTemplate>
</tbody>
</table>
</div>
</div>
</div>
</FooterTemplate>
</asp:Repeater>
</div>
</div>
<div class="modal-footer">
<button type="button" class="btn btn-secondary" data-bs-dismiss="modal">Chiudi</button>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
</ItemTemplate>
</asp:Repeater>
<asp:Button
ID="btnResetFiles"
runat="server"
OnClick="btnResetFiles_Click"
Text="Reset files"
CssClass="btn btn-danger"
Visible="false" />
</div>
</div>
<div id="divFileAggiuntivi" runat="server">
<h6 class="mt-3">Carica i file FASTA</h6>
<div class="alert alert-warning d-flex align-items-center" role="alert">
<i class="bi flex-shrink-0 me-2 fa-solid fa-triangle-exclamation"></i>
<div>
<strong>Attenzione:</strong> caricare molti file FASTA aumenterà l'elaborazione dei dati.
Per evitare lunghe attese o timeout della pagina si suggerisce di filtrare i dati
in base alle proprie necessità e successivamente caricare i file per aggregarli nella tabella.
In questo modo verranno associati soltanto i FASTA dei dati filtrati.
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-5">
<asp:FileUpload ID="fileCaricatoFasta" runat="server" CssClass="form-control" AllowMultiple="true" accept=".fasta" />
<asp:Button
ID="btnCaricaFasta"
runat="server"
ClientIDMode="Static"
Text="Carica file"
CssClass="btn btn-secondary mt-2"
OnClick="ImportFasta"
OnClientClick="showLoading();" />
</div>
<div class="col-md-7">
<asp:Literal ID="Literal1" runat="server" Visible="false"></asp:Literal>
</div>
</div>
<h6 class="mt-3">Carica i file CDS</h6>
<div class="alert alert-warning d-flex align-items-center" role="alert">
<i class="bi flex-shrink-0 me-2 fa-solid fa-triangle-exclamation"></i>
<div>
<strong>Attenzione:</strong> caricare molti file CDS aumenterà l'elaborazione dei dati.
Per evitare lunghe attese o timeout della pagina si suggerisce di filtrare i dati
in base alle proprie necessità e successivamente caricare i file per aggregarli nella tabella.
In questo modo verranno associati soltanto i CDS dei dati filtrati.
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-5">
<asp:FileUpload ID="fileCaricatoCDS" runat="server" CssClass="form-control" AllowMultiple="true" accept=".cds.fa" />
<asp:Button
ID="btnCaricaCDS"
runat="server"
ClientIDMode="Static"
Text="Carica file"
CssClass="btn btn-secondary mt-2"
OnClick="ImportCDS"
OnClientClick="showLoading();" />
</div>
<div class="col-md-7">
<asp:Literal ID="Literal2" runat="server" Visible="false"></asp:Literal>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<!-- Card Filtri -->
<div id="CardFiltri" runat="server" class="card p-3">
<h5 class="card-title">
<i class="fa-solid fa-filter"></i>
Filtri
</h5>
<p class="card-text">
Filtrare i risultati per parole che devono/non devono essere presenti con la possibilità di selezionare su quale colonna/colonne
effettuare la ricerca.
</p>
<div class="card-body">
<div class="row">
<div class="col-md-3">
<asp:Label ID="lblFiltro" runat="server"><strong>Contiene:</strong>
<span
class="info-color"
data-bs-toggle="tooltip"
data-bs-placement="top"
title="è possibile impostare 1 o più parole da ricercare in modo da filtrare i dati che le contengono.">
<i class="fa-solid fa-circle-info"></i>
</span>
</asp:Label>
</div>
<div class="col-md-9">
<div class="ele-contiene" style="">
<div class="ele-contiene-list list-group w-75"></div>
<div class="input-group mb-3 w-75">
<input type="text"
class="ele-contiene-edit form-control"
placeholder="Parola da ricercare"
aria-label="Parola da ricercare"
aria-describedby="basic-addon2">
<div class="input-group-append">
<button class="ele-contiene-add btn btn-success"
role="button"
type="button">
<i class="fa fa-plus" aria-hidden="true"></i>
Aggiungi
</button>
</div>
</div>
<asp:HiddenField ID="valoriContiene" runat="server" ClientIDMode="Static" />
</div>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-3">
<asp:Label ID="lblNonContiene" runat="server">
<strong>Non contiene:</strong>
<span
class="info-color"
data-bs-toggle="tooltip"
data-bs-placement="top"
title="è possibile impostare 1 o più parole da ricercare in modo da filtrare i dati che NON le contengono.">
<i class="fa-solid fa-circle-info"></i>
</span>
</asp:Label>
</div>
<div class="col-md-9">
<div class="ele-noncontiene">
<div class="ele-noncontiene-list list-group w-75"></div>
<div class="input-group mb-3 w-75">
<input type="text"
class="ele-noncontiene-edit form-control"
placeholder="Parola da rimuovere"
aria-label="Parola da rimuovere"
aria-describedby="basic-addon2">
<div class="input-group-append">
<button class="ele-noncontiene-add btn btn-success"
role="button"
type="button">
<i class="fa fa-plus" aria-hidden="true"></i>
Aggiungi
</button>
</div>
</div>
<asp:HiddenField ID="valoriNonContiene" runat="server" ClientIDMode="Static" />
</div>
</div>
</div>
<div class="row mb-3">
<div class="col-md-2">
<strong>Ricerca in:</strong>
<span
class="info-color"
data-bs-toggle="tooltip"
data-bs-placement="top"
title="è possibile impostare le colonne in cui ricercare le parole da filtrare o escludere dalla tabella.">
<i class="fa-solid fa-circle-info"></i>
</span>
</div>
<div class="col-md-10">
<asp:CheckBoxList ID="cklColonne" runat="server" ClientIDMode="Static" AutoPostBack="false" RepeatLayout="Table" RepeatDirection="Horizontal">
<asp:ListItem Value="File" Selected="False">File</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Sequid" Selected="False">Sequid</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Source" Selected="False">Source</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Type" Selected="False">Type</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Start" Selected="False">Start</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="End" Selected="False">End</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Score" Selected="False">Score</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Strand" Selected="False">Strand</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Phase" Selected="False">Phase</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="Attributes" Selected="True">Attributes</asp:ListItem>
</asp:CheckBoxList>
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-3">
<strong>Sottolinea parole ricercate:</strong>
<span
class="info-color"
data-bs-toggle="tooltip"
data-bs-placement="top"
title="Permette di evidenziare in giallo nella tabella le parole ricercate in modo da avere una visione immediata del dato.">
<i class="fa-solid fa-circle-info"></i>
</span>
</div>
<div class="col-md-9">
<asp:CheckBox ID="chkSottolineaParole" runat="server" ClientIDMode="Static" />
</div>
</div>
<div class="row">
<div class="col-md-3">
<strong>Raggruppa i risultati per SEQUID:</strong>
<span
class="info-color"
data-bs-toggle="tooltip"
data-bs-placement="top"
title="Permette raggruppare i risultati della tabella con lo stesso SEQUID nella pagina attuale.">
<i class="fa-solid fa-circle-info"></i>
</span>
</div>
<div class="col-md-9">
<asp:CheckBox ID="chkRaggruppaRisultati" runat="server" ClientIDMode="Static" />
</div>
<div class="alert alert-warning d-flex align-items-center" role="alert">
<i class="bi flex-shrink-0 me-2 fa-solid fa-triangle-exclamation"></i>
<div>
<strong>Attenzione:</strong> nella modalità di visione per "raggruppamento" verrà mostrato soltanto il primo
risultato e gli altri con lo stesso SEQUID verranno nascosti.
Per questa modalità <strong>SI CONSIGLIA</strong> di utilizzare l'ordinamento
per SEQUID (di default) per una visione corretta dei risultati.
Cliccando nell'icona <i class="fa-solid fa-angles-down"></i>verranno mostrati gli altri
risultati (se ci sono) e si potranno visionare e selezionare eventualmente. Cliccando nuovamente sull'icona
<i class="fa-solid fa-angles-down"></i>verranno nascosti i risultati e rimosse eventuali selezioni delle righe.
</div>
</div>
</div>
<div class="alert alert-info d-flex align-items-center" role="alert">
<i class="bi flex-shrink-0 me-2 fa-solid fa-circle-info"></i>
<div>
<strong>Esempio: </strong>
Devo filtrare i risultati in modo da avere soltanto quelli che contengono la parola "mitochondrial" nella colonna "Attributes".
In questo caso dovrò prima impostare la parola su "Contiene" e cliccare su "Aggiungi" per confermare, successivamente,
in "Ricerca in" rimuovo la spunta da tutte le checkbox lasciando attiva soltanto quella di "Attributes".
Infine clicco sul pulsante "Applica i filtri" per avviare la ricerca dei risultati.
</div>
</div>
<div style="display: inline-flex;">
<asp:Button
ID="btnRicerca"
runat="server"
CssClass="btn btn-primary btn-operazioni me-2"
Text="Applica i filtri"
OnClick="btnSearch_Click"
OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button
ID="btnEliminaFiltri"
runat="server"
CssClass="btn btn-danger btn-operazioni"
Text="Elimina filtri"
OnClick="btnEliminaFiltri_Click" />
<%--<asp:Button
ID="btnEsportaExcel"
runat="server"
CssClass="btn btn-secondary btn-operazioni"
Text="Esporta excel"
OnClick="btnEsportaExcel_Click" />--%>
</div>
</div>
</div>
<!-- Card esportazione -->
<div id="CardEsportazione" runat="server" class="card p-3">
<h5 class="card-title">
<i class="fa-solid fa-file-export"></i>
Esporta
</h5>
<p class="card-text">
Esportazione dei dati nel formato richiesto.
La funzionalità permette di esportare dei dati custom come ad esempio combinazioni di file gff3, specifiche righe, dati aggregati come fasta e cds.
Inoltre i file esportati saranno filtrati e ordinati in base ai dati presenti nella tabella.
</p>
<div class="card-body">
<div class="d-inline-flex">
<asp:Button
ID="btnEsportaGff3"
runat="server"
CssClass="btn btn-secondary btn-operazioni me-2"
Text="Esporta GFF3"
OnClick="btnEsportaGFF3_Click" />
<asp:Button
ID="btnEsportaCds"
runat="server"
CssClass="btn btn-secondary btn-operazioni me-2"
Text="Esporta CDS"
OnClick="btnEsportaCDS_Click" />
<asp:Button
ID="btnEsportaExcel"
runat="server"
CssClass="btn btn-secondary btn-operazioni"
Text="Esporta Excel"
OnClick="ExportToNewExcel_Click" />
</div>
</div>
</div>
</asp:Panel>
</div>
<!-- stato -->
<div class="stato">
<asp:Label ID="stato" runat="server"></asp:Label>
<div id="numeroRisultatiAccorpati"></div>
</div>
<!-- pulsanti tabella -->
<div id="pulsantiColonne" runat="server" visible="false">
<div class="row">
<div class="col-md-2">
<asp:Label ID="lblPulsantiColonne" runat="server"><strong>Mostra/Nascondi colonne:</strong></asp:Label>
</div>
<div class="col-md-8">
<asp:Button ID="colonna0" runat="server" CommandName="1" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="File" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna1" runat="server" CommandName="4" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Sequid" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna2" runat="server" CommandName="5" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Source" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna3" runat="server" CommandName="6" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Type" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna4" runat="server" CommandName="7" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Start" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna5" runat="server" CommandName="8" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="End" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna6" runat="server" CommandName="9" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Score" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna7" runat="server" CommandName="10" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Strand" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna8" runat="server" CommandName="11" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Phase" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
<asp:Button ID="colonna9" runat="server" CommandName="12" OnClick="mostraNascondiColonne" Text="Attributes" CssClass="btn btn-success" OnClientClick="showLoading();" />
</div>
<div class="col-md-2">
<strong>Risultati:</strong>
<asp:DropDownList
ID="ddlNumeroPagine"
runat="server"
AutoPostBack="true"
OnSelectedIndexChanged="ddlNumeroRisultati_SelectedIndexChanged">
<asp:ListItem Value="100" Selected="True">100</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="500">500</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="1000">1000</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="2000">2000</asp:ListItem>
<asp:ListItem Value="4000">4000</asp:ListItem>
</asp:DropDownList>
</div>
</div>
</div>
<!-- Tabella -->
<asp:GridView
ID="gdvBiocoso"
ClientIDMode="Static"
runat="server"
OnRowDataBound="gdvBiocoso_RowDataBound"
OnPageIndexChanging="gdvBiocoso_PageIndexChanging" AllowPaging="true" PageSize="100"
OnSorting="gdvBiocoso_Sorting" AllowSorting="true" CurrentSortDir="ASC" CurrentSortField="sequid"
AlternatingRowStyle-CssClass="alt"
AutoGenerateColumns="false"
Width="100%" border="1" CellPadding="3" CssClass="table table-striped table-bordered table-hover"
Style="border: 1px solid #E5E5E5; word-break: break-all; word-wrap: break-word">
<HeaderStyle CssClass="StickyHeader" />
<PagerStyle CssClass="Footer" />
<Columns>
<asp:TemplateField HeaderText="" ItemStyle-CssClass="short tdSelezione" HeaderStyle-CssClass="short">
<HeaderTemplate>
<input class="form-check-input" type="checkbox" id="chkSelezionaTutto" value="" aria-label="seleziona-tutto">
<span id="numero-elementi-selezionati">0</span>
</HeaderTemplate>
<ItemTemplate>
<asp:CheckBox ID="chkSelezione" runat="server" HeaderText="Seleziona" CssClass="seleziona-elemento" />
<%-- <input class="form-check-input seleziona-elemento" type="checkbox" id="chkSelezione" runat="server" value="" aria-label="seleziona">--%>
</ItemTemplate>
</asp:TemplateField>
<asp:BoundField DataField="File" HeaderText="File" SortExpression="file" ItemStyle-CssClass="tdFile" />
<asp:TemplateField HeaderText="Fasta" ItemStyle-CssClass="short tdFasta" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="fasta">
<ItemTemplate>
<button
type="button"
class="btn btn-outline-secondary FastaButton"
style='<%#(Eval("Fasta") == null || Eval("Fasta") == "" ? "display: none;": "")%>'
data-bs-toggle="popover"
title="Stringa del file Fasta"
data-bs-content='<%# Eval("Fasta") %>'>
<i class="fa-solid fa-eye"></i>
</button>
</ItemTemplate>
</asp:TemplateField>
<asp:TemplateField HeaderText="CDS" ItemStyle-CssClass="short tdCDS" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="CDS">
<ItemTemplate>
<button
type="button"
class="btn btn-outline-secondary CdsButton"
data-bs-toggle="popover"
style='<%#(Eval("CDS") == null || Eval("CDS") == "" ? "display: none;": "")%>'
title="Stringa del file CDS"
data-bs-content='<%# Eval("CDS") %>'>
<i class="fa-solid fa-eye"></i>
</button>
</ItemTemplate>
</asp:TemplateField>
<asp:BoundField DataField="Sequid" HeaderText="Sequid" ItemStyle-CssClass="short tdSequid" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="sequid" />
<asp:BoundField DataField="Source" HeaderText="Source" ItemStyle-CssClass="short tdSource" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="source" />
<asp:BoundField DataField="Type" HeaderText="Type" ItemStyle-CssClass="short tdType" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="type" />
<asp:BoundField DataField="Start" HeaderText="Start" ItemStyle-CssClass="short tdStart" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="start" />
<asp:BoundField DataField="End" HeaderText="End" ItemStyle-CssClass="short tdEnd" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="end" />
<asp:BoundField DataField="Score" HeaderText="Score" ItemStyle-CssClass="short tdScore" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="score" />
<asp:BoundField DataField="Strand" HeaderText="Strand" ItemStyle-CssClass="short tdStrand" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="strand" />
<asp:BoundField DataField="Phase" HeaderText="Phase" ItemStyle-CssClass="short tdPhase" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="phase" />
<asp:TemplateField HeaderText="Attributes" ItemStyle-CssClass="short tdAttributes" HeaderStyle-CssClass="short" SortExpression="attributes">
<ItemTemplate>
<asp:Repeater runat="server" DataSource='<%# Eval("Attributes") %>'>
<ItemTemplate>
<%-- <%# Container.DataItem.ToString() ?? string.Empty%><br />--%>
<asp:Literal runat="server" Text='<%# GetFormattedAttribute(Container.DataItem) %>'></asp:Literal><br />
</ItemTemplate>
</asp:Repeater>
</ItemTemplate>
</asp:TemplateField>
</Columns>
</asp:GridView>
<button
type="button"
class="btn btn-danger btn-floating btn-lg"
id="btn-back-to-top">
<i class="fas fa-arrow-up"></i>
</button>
</div>
<!-- Tipo campo Elenco -->
<script>
function removeItemContiene(el) {
let hid = $('.ele-contiene input[type=hidden]')
let valoreStringa = el.parent('.list-group-item').attr('valoreStringa')
if (hid.length > 0 && hid.val() != null) {
// ottengo un array degli elementi della lista
listaDati = hid.val().split(';')
// rimuovo elemento da array
for (var i = listaDati.length - 1; i >= 0; i--) {
if (listaDati[i] === valoreStringa) {
listaDati.splice(i, 1)
break
}
}
// aggiorno la input hidden
hid.val(listaDati.join(';'))
// eliminazione elemento dalla lista
$('.ele-contiene-list .list-group-item').each(function () {
let value = $(this).children('span').text()
if (value == valoreStringa) {
// elimino la riga
$(this).remove()
}
})
}
}
function removeItemContieneEdit(el) {
let valoreStringa = el.parent('.list-group-item').attr('valoreStringa')
let hid = $('#valoriContiene')
if (hid.length > 0 && hid.val() != null) {
// ottengo un array degli elementi della lista
listaDati = hid.val().split(';')
// rimuovo elemento da array
for (var i = listaDati.length - 1; i >= 0; i--) {
if (listaDati[i] === valoreStringa) {
listaDati.splice(i, 1)
break
}
}
// aggiorno la input hidden
hid.val(listaDati.join(';'))
// eliminazione elemento dalla lista
$('.ele-contiene-list .list-group-item').each(function () {
let value = $(this).children('span').text()
if (value == valoreStringa) {
// elimino la riga
$(this).remove()
}
})
}
}
function loadListContieneInEdit() {
// carico hidden con gli elementi dell'elenco
let loadedHid = $('#valoriContiene')
if (loadedHid && loadedHid.val()) {
// ottengo un array degli elementi della lista
let listaDati = loadedHid.val().split(';')
// visualizzo la lista
listaDati.forEach(element => {
$('.ele-contiene-list').append(
'<div class="list-group-item" valoreStringa="' + escapeHtml(element) + '"><span>' + element + '</span>' +
'<button class="ele-contiene-remove btn btn-danger btn-sm" onclick="removeItemContieneEdit(' +
'$(this)' + ')" role="button" type="button">' +
'<i class="fa fa-trash" aria-hidden="true"></i>' +
'</button>' +
'</div>'
)
})
}
}
$(document).ready(function () {
// carico la lista in modifica
loadListContieneInEdit()
$('.ele-contiene-add').click(function () {
let edit = $(this).parent().siblings('.ele-contiene-edit')
if (edit.length > 0 && edit.val() != '') {
// valore nuovo elemento
let oldElement = $.trim(edit.val())
let newElement = escapeHtml(oldElement)
// pulisco la textbox di input
edit.val('')
// inserisco elemento nel campo hidden
let hid = $(this).parent().parent().siblings('input[type=hidden]')
let hidText = hid.val() == '' ? oldElement : ';' + oldElement
hid.val(hid.val() + hidText)
// inserisco elemento nella lista
let list = $(this).parent().parent().siblings('.ele-contiene-list')
list.append(
'<div class="list-group-item" valoreStringa="' + newElement + '"><span>' + newElement + '</span>' +
'<button class="ele-contiene-remove btn btn-danger btn-sm" onclick="removeItemContiene(' +
'$(this)' + ')" role="button" type="button">' +
'<i class="fa fa-trash" aria-hidden="true"></i>' +
'</button>' +
'</div>'
)
}
})
})
</script>
<script>
function removeItem(el) {
let hid = $('.ele-noncontiene input[type=hidden]')
let valoreStringa = el.parent('.list-group-item').attr('valoreStringa')
if (hid.length > 0 && hid.val() != null) {
// ottengo un array degli elementi della lista
listaDati = hid.val().split(';')
// rimuovo elemento da array
for (var i = listaDati.length - 1; i >= 0; i--) {
if (listaDati[i] === valoreStringa) {
listaDati.splice(i, 1)
break
}
}
// aggiorno la input hidden
hid.val(listaDati.join(';'))
// eliminazione elemento dalla lista
$('.ele-noncontiene-list .list-group-item').each(function () {
let value = $(this).children('span').text()
if (value == valoreStringa) {
// elimino la riga
$(this).remove()
}
})
}
}
function removeItemEdit(el) {
let valoreStringa = el.parent('.list-group-item').attr('valoreStringa')
let hid = $('#valoriNonContiene')
if (hid.length > 0 && hid.val() != null) {
// ottengo un array degli elementi della lista
listaDati = hid.val().split(';')
// rimuovo elemento da array
for (var i = listaDati.length - 1; i >= 0; i--) {
if (listaDati[i] === valoreStringa) {
listaDati.splice(i, 1)
break
}
}
// aggiorno la input hidden
hid.val(listaDati.join(';'))
// eliminazione elemento dalla lista
$('.ele-noncontiene-list .list-group-item').each(function () {
let value = $(this).children('span').text()
if (value == valoreStringa) {
// elimino la riga
$(this).remove()
}
})
}
}
function loadListInEdit() {
// carico hidden con gli elementi dell'elenco
let loadedHid = $('#valoriNonContiene')
if (loadedHid && loadedHid.val()) {
// ottengo un array degli elementi della lista
let listaDati = loadedHid.val().split(';')
// visualizzo la lista
listaDati.forEach(element => {
$('.ele-noncontiene-list').append(
'<div class="list-group-item" valoreStringa="' + escapeHtml(element) + '"><span>' + element + '</span>' +
'<button class="ele-noncontiene-remove btn btn-danger btn-sm" onclick="removeItemEdit(' +
'$(this)' + ')" role="button" type="button">' +
'<i class="fa fa-trash" aria-hidden="true"></i>' +
'</button>' +
'</div>'
)
})
}
}
$(document).ready(function () {
// carico la lista in modifica
loadListInEdit()
$('.ele-noncontiene-add').click(function () {
let edit = $(this).parent().siblings('.ele-noncontiene-edit')
if (edit.length > 0 && edit.val() != '') {
// valore nuovo elemento
let oldElement = $.trim(edit.val())
let newElement = escapeHtml(oldElement)
// pulisco la textbox di input
edit.val('')
// inserisco elemento nel campo hidden
let hid = $(this).parent().parent().siblings('input[type=hidden]')
let hidText = hid.val() == '' ? oldElement : ';' + oldElement
hid.val(hid.val() + hidText)
// inserisco elemento nella lista
let list = $(this).parent().parent().siblings('.ele-noncontiene-list')
list.append(
'<div class="list-group-item" valoreStringa="' + newElement + '"><span>' + newElement + '</span>' +
'<button class="ele-noncontiene-remove btn btn-danger btn-sm" onclick="removeItem(' +
'$(this)' + ')" role="button" type="button">' +
'<i class="fa fa-trash" aria-hidden="true"></i>' +
'</button>' +
'</div>'
)
}
})
})
</script>
<script>
var entityMap = {
'&': '&',
'<': '<',
'>': '>',
'"': '"',
"'": ''',
'/': '/',
'`': '`',
'=': '='
};
function escapeHtml(string) {
return String(string).replace(/[&<>"'`=\/]/g, function (s) {
return entityMap[s];
});
}
</script>
<!-- evidenzia parole -->
<script>
$(document).ready(function () {