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【PaddlePaddle Hackathon】84 药物虚拟筛选系统设计 #150

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Fairly opened this issue Sep 23, 2021 · 0 comments
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【PaddlePaddle Hackathon】84 药物虚拟筛选系统设计 #150

Fairly opened this issue Sep 23, 2021 · 0 comments

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@Fairly
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Fairly commented Sep 23, 2021

(此 ISSUE 为 PaddlePaddle Hackathon 活动的任务 ISSUE,更多详见PaddlePaddle Hackathon

螺旋桨(PaddleHelix)是一个生物计算工具集,是用机器学习的方法,特别是深度神经网络,致力于促进以下领域的发展:新药发现疫苗设计精准医疗 等。

【任务说明】

  • 任务题目:药物虚拟筛选系统设计

  • 技术标签:深度学习、C++、python、生物计算

  • 任务难度:简单

  • 详细说明:虚拟筛选(Virtual Screening)是药物研发中的重要一环,其目的是从大量化合物中筛选出具备高生物活性的化合物,进而进行生物活性实验的验证。过往,一般是直接通过高通量筛选技术进行药物筛选,成本高,耗时长。近几年,随着机器学习和深度学习技术的发展,融合 AI 算法的药物虚拟筛选技术,能够大大提升药物筛选的效率,并越来越多的受到青睐。在这个任务中,需要你借助 PaddleHelix 提供的化合物活性预测(或称药物靶点相互作用,DTI)模型,设计药物虚拟筛选的系统及功能,以更好的辅助药物研发人员进行药物筛选。

【提交内容】

  1. 项目 PR 到 PaddleHelix
  2. 相关技术文档
  3. 项目单测文件

【技术要求】

  • 了解药物的虚拟筛选流程
  • 了解 Paddle 相关的技术背景
  • 产出一个药物虚拟筛选系统
  • 若系统包含可视化模块可额外加分
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