-
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 3
/
Large_table_previewer.py
63 lines (50 loc) · 3.31 KB
/
Large_table_previewer.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
print('''
Python3-скрипт, выводящий первые n строк большого текстового файла.
Автор: Платон Быкадоров (platon.work@gmail.com), 2018-2019.
Версия: V3.0.
Лицензия: GNU General Public License version 3.
Поддержать проект: https://money.yandex.ru/to/41001832285976
Простое руководство по установке среды разработки и запуску скриптов:
github.com/PlatonB/bioinformatic-python-scripts#Установка-среды-разработки
Файлы, размеры которых исчисляются гигабайтами, практически
невозможно предпросмотреть на обычном десктопе.
Этот скрипт позволяет определить по первым строкам,
из каких столбцов состоит огромная таблица.
Ознакомление с общим видом таблицы сделает возможным
создавать специализированные программы для её обработки.
Поддерживаются текстовые файлы в обычном и сжатом ((b)gzip) виде.
Не выводите не экран слишком много строк (тысячи), т.к.
консоль, в которой вы запускаете скрипт, может зависнуть.
''')
import sys, re, gzip, os
src_file_path = input('Путь к исходному файлу (текст или gz/bgz-архив): ')
str_quan = int(input('\nКоличество выводимых или перенаправляемых строк: '))
redirection = input('''\nПеренаправить результат в отдельный файл?
(игнорирование ввода ==> вывести результат на экран)
[redirect(|r)|<enter>]: ''')
if redirection not in ['redirect', 'r', '']:
print(f'{redirection} - недопустимая опция')
sys.exit()
#Открытие на чтение (b)gzip-архива.
if re.search(r'\.b?gz$', src_file_path) != None:
src_file_opened = gzip.open(src_file_path, mode='rt')
#Открытие на чтение текстового файла.
else:
src_file_opened = open(src_file_path)
#Выбрано перенаправление в файл.
if redirection in ['redirect', 'r']:
trg_dir_path = input('\nПуть к папке для конечного файла: ')
trg_file_name = '.'.join(os.path.basename(src_file_path).split('.')[:-1]) + '_fir_' + str(str_quan) + '.txt'
with open(os.path.join(trg_dir_path, trg_file_name), 'w') as trg_file_opened:
for num in range(str_quan):
line = src_file_opened.readline()
if line.find('\n') == -1:
line += '\n'
trg_file_opened.write(line)
#Выбран вывод на экран.
else:
print('')
for num in range(str_quan):
line = src_file_opened.readline().split('\n')[0]
print(line)
src_file_opened.close()