add_headline.md

tsv-utils 之制表符添加表头： add_headline

一、tsv-utils add_headline 介绍

功能描述：

tsv-utils add_headline 主要功能为对制表符文件添加表头；

命令行接口：

$ tsv-utils add_headline

Usage: tsv-utils add_headline <header: "string"> <text>

二、使用场景实例及其用法

使用场景经典案例：

1. BLAST 表格输出文件，添加制表符文件表头，让文档更易懂。

示例演示：

示例文件： megablast.txt，SILVA_123_SSURef.txt

$ cat  megablast.txt | head -n6


ZOTU_1  JQ088343.1.1479 100.000 404     0       0       1       404     355     758     0.0     747
ZOTU_2  JF138741.1.1356 100.000 429     0       0       1       429     323     751     0.0     793
ZOTU_3  LN568336.1.1321 98.765  405     4       1       1       404     298     702     0.0     719
ZOTU_4  FJ672447.1.1441 99.764  424     1       0       1       424     355     778     0.0     778
ZOTU_5  EU542474.1.1489 100.000 424     0       0       1       424     353     776     0.0     784
ZOTU_6  JQ072613.1.1343 100.000 404     0       0       1       404     270     673     0.0     747

运行命令：

$ tsv-utils add_headline  "#qseqid\tsseqid\tpident\tlength\tmismatch\tgapopen\tqstart\tqend\tsstart\tsend\tevalue\tbitscore" megablast.txt  | head   -n6


#qseqid sseqid  pident  length  mismatch        gapopen qstart  qend    sstart  send    evalue  bitscore
ZOTU_1  JQ088343.1.1479 100.000 404     0       0       1       404     355     758     0.0     747
ZOTU_2  JF138741.1.1356 100.000 429     0       0       1       429     323     751     0.0     793
ZOTU_3  LN568336.1.1321 98.765  405     4       1       1       404     298     702     0.0     719
ZOTU_4  FJ672447.1.1441 99.764  424     1       0       1       424     355     778     0.0     778
ZOTU_5  EU542474.1.1489 100.000 424     0       0       1       424     353     776     0.0     784

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Last Update: 8/30/2020 7:21:56 PM