Iniciación en R para científicos

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Taller dictado el 5 de mayo de 2022 por medio de la plataforma Discord en el cual se tocaron aspectos generales de la programación en R. En este repositorio se incluyen los archivos utilizados durante el mismo y el script de R usado. Puede seguir la grabación de este taller haciendo click aquí.

Contenido

1. Inicio. Conceptos básicos

1. ¿Qué es R?
2. ¿Cómo descargar R y RStudio?
3. Vista general de RStudio
   • Script, consola, entorno y utilidades
   • Operaciones aritméticas
   • Guardar variables
   • Borrar variables
4. Establecer directorio, guardar y abrir archivos
5. Ver tablas
6. Instalar paquetes (CRAN y GitHub)
7. Usar paquetes
8. Citar paquetes
9. Crear, visualizar y guardar gráficos (ggplot2)

2. Importar datos de Excel, CSV y texto plano

1. Importar datos de Excel
2. Importar datos de CSV
3. Importar datos de texto plano (UC y Ensembl)

3. Estadísticas básicas e inferencia a partir de datos existentes

1. Función summary (resumen de todas las variables de la tabla)
2. Función sum (suma de datos numéricos)
3. Funciones min y max (máximo y mínimo)
4. Función mean (promedio o media)
5. Función sd (desviación estándar muestral) y sd.population (desviación estándar poblacional, paquete propio)
6. Función by (desplegar los datos de summary por categorías)
7. Inferir datos (ejemplo del tamaño de genes)

4. Filtrar y reordenar

1. Filtrar datos
2. Ordenar (orden ascendente y orden descendente)
3. Reordenar factores

5. Tipos de gráficos

1. Gráfico de barra
2. Gráfico de puntos
3. Gráfico de caja y bigotes
4. Histograma
5. Gráfico de densidad
6. Contornos geográficos (caso especial)

6. Retocar gráficos

1. Cambiar títulos de los ejes y de la leyenda
2. Añadir título y subtítulo
3. Cambiar tamaño y tipo de fuente
4. Mover o eliminar la leyenda
5. Añadir transparencia
6. Desplegar datos por categorías (facet_wrap y facet_grid)
7. Colores (por RColorBrewer y manualmente)

7. Algunas pruebas de hipótesis

1. Regresión
2. t de Student
3. ANOVA
4. Chi-cuadrado de homogeneidad