-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Copy pathsetup_arg_parser.py
160 lines (133 loc) · 8.52 KB
/
setup_arg_parser.py
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
import argparse
def setup_arg_parser():
parser = argparse.ArgumentParser()
#############################################################################################
# Basic CLI arguments
#############################################################################################
# set path to config file
parser.add_argument('--conf', type=str)
# set seeds to ensure reproducibility
parser.add_argument('--train_args.seed', type=int, default=0)
# specify data loader parameters
parser.add_argument('--batch_size', type=int)
parser.add_argument('--num_workers', type=int, default=8)
parser.add_argument('--num_threads', type=int, default=1)
# specify training parameters
parser.add_argument("--debug", type=str2bool, help="Use a subset of a few datapoints, meant for debugging.", default=False)
parser.add_argument("--validate", type=str2bool, help="Whether to validate on val split after every epoch.", default=True)
parser.add_argument("--gpu-ids", nargs="+", type=int, default=0, help="List of ids of GPUs to use.")
# wandb
parser.add_argument("--wandb", type=str2bool, help="Log results to wandb.", default=False)
#############################################################################################
# Dataset arguments
#############################################################################################
parser.add_argument('--data.dataset_path', type=str)
parser.add_argument('--data.split_path', type=str)
parser.add_argument('--data.extra_aug', type=int)
parser.add_argument('--data.switch_to_canon', type=str2bool)
#############################################################################################
# Optimization arguments
#############################################################################################
parser.add_argument('--optimization.optimizer_name', type=str)
parser.add_argument('--optimization.clip_grad', type=str2bool)
parser.add_argument('--optimization.clip_grad_max_norm', type=float)
parser.add_argument('--optimization.optimizer_args.lr', type=float)
parser.add_argument('--optimization.optimizer_args.weight_decay', type=float)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.scheduler', type=str)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.scheduler_mode', type=str)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.decay_rate', type=float)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.decay_steps', type=float)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.patience', type=float)
parser.add_argument('--optimization.scheduler_args.min_lr', type=float)
parser.add_argument('--train_args.num_epochs', type=int)
parser.add_argument('--train_args.val_acc_threshold', type=float)
parser.add_argument('--train_args.patience', type=int)
parser.add_argument('--train_args.loss', type=str)
#############################################################################################
# ScaleNet arguments
#############################################################################################
parser.add_argument('--scalegmn_args.d_in_v', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.d_in_e', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.d_hid', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.num_layers', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.direction', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.symmetry', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.jit', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.compile', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.readout_range', type=str, choices=['last_layer', 'full_graph'])
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_skip_connections', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.concat_mlp_directions', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.reciprocal', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.node_pos_embed', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.edge_pos_embed', type=str2bool)
# graph_init
parser.add_argument('--scalegmn_args.graph_init.project_node_feats', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.graph_init.project_edge_feats', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.graph_init.input_layers', type=int)
# positional encodings
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.final_linear_pos_embed', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.sum_pos_enc', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.po_as_different_linear', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.equiv_net', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.sum_on_io', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.equiv_on_hidden', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.num_mlps', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.positional_encodings.layer_equiv_on_hidden', type=str2bool)
# gnn_args
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.message_fn_layers', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.message_fn_skip_connections', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.update_node_feats_fn_layers', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.update_node_feats_fn_skip_connections', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.update_edge_attr', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.dropout', type=float)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.dropout_all', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.msg_equiv_on_hidden', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.layer_msg_equiv_on_hidden', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.upd_equiv_on_hidden', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.layer_upd_equiv_on_hidden', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.mlp_on_io', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.msg_num_mlps', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.upd_num_mlps', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.pos_embed_msg', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.pos_embed_upd', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.update_as_act', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.update_as_act_arg', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.aggregator', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.gnn_args.sign_symmetrization', type=str2bool)
# mlp_args
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.d_k', type=str2list2int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.activation', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.dropout', type=float)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.final_activation', type=str)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.batch_norm', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.layer_norm', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.bias', type=str2bool)
parser.add_argument('--scalegmn_args.mlp_args.skip', type=str2bool)
# readout_args
parser.add_argument('--scalegmn_args.readout_args.d_rho', type=int)
parser.add_argument('--scalegmn_args.readout_args.d_out', type=int)
#############################################################################################
# Wandb arguments
#############################################################################################
parser.add_argument('--wandb_args.project', type=str)
parser.add_argument('--wandb_args.config_file', type=str)
parser.add_argument('--wandb_args.entity', type=str)
parser.add_argument('--wandb_args.name', type=str)
parser.add_argument('--wandb_args.group', type=str)
parser.add_argument('--wandb_args.tags', type=str)
return parser
def str2bool(v):
if v.lower() in ('yes', 'true', '1'):
return True
elif v.lower() in ('no', 'false', '0'):
return False
else:
raise argparse.ArgumentTypeError('Boolean value expected.')
def str2list(v):
return [c for c in v.split(',')]
def str2list2int(v):
return [int(c) for c in v.split(',')]
def none_or_str(value):
if isinstance(value, str) and value.lower() == 'none':
return None
return value