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update docs fix #122 #124

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Mar 25, 2024
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1 change: 1 addition & 0 deletions docs/index.md
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -16,6 +16,7 @@ caption: Usage
maxdepth: 1
---
Installation <usage/installation>
Filtrage avancé (SQL) <usage/advanced_filter>
```

```{toctree}
Expand Down
37 changes: 37 additions & 0 deletions docs/usage/advanced_filter.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,37 @@
# Filtres personnalisés en langage SQL

📢 Pour chaque traitement, il vous est possible de **filtrer de manière personnalisée** les données traitées, en ajoutant des **clauses "where" en langage SQL** dans les `Paramètres avancés`. Vous trouverez ci-dessous les exemples possibles.

## Filtres classiques

> [!IMPORTANT]
> A partir de la version `3.0.0`, le `and` en début de requête n'est plus à mentionner.

|Filtrer sur...|Un seul critère|Plusieurs critères|
|-|-|-|
|id espèce VisioNature|`and source_id_sp = 386`|`and source_id_sp in (386, 394, 370)`|
|cd_nom|`and obs.cd_nom = 4001`|`and obs.cd_nom in (4001, 4035, 3764)`|
|Nom vernaculaire|`and t.nom_vern ilike 'Rougegorge familier'` ou `and t.nom_vern ilike '%rougegorge%'`|`and t.nom_vern in ('Rougegorge familier', 'Rougequeue noir', 'Mésange charbonnière')`|
|Nom scientifique|`and t.lb_nom ilike 'erithacus rubecula'`|`and t.lb_nom in ('Erithacus rubecula', 'Phoenicurus ochruros', 'Parus major')`|
|Observateur|`and observateur = 'NOM Prénom'`|`and observateur in ('NOM Prénom', 'NOM Prénom', 'NOM Prénom')`|
|Code de nidification|`and oiso_code_nidif = 1`|`and oiso_code_nidif in (1, 2, 3)`|
|Statut de reproduction (valable pour tous les groupes taxo)|`and statut_repro = 'Certain'`|`and statut_repro in ('Certain', 'Probable', 'Possible')`|
|Cause de mortalité|`and mortalite_cause = 'ROAD_VEHICLE'`|`and mortalite_cause in ('ROAD_VEHICLE', 'HUNTING')`|
|Code étude|`and code_etude = 'EPOC'`|`and code_etude in ('EPOC', 'EPOC-ODF')`|

La fonction `ilike` permet de s'affranchir des majuscules et minuscules. Le % remplace un ou plusieurs caractères (et ne fonctionne qu'avec ilike).


## Autres filtres plus complexes

- Filtrer sur l'**altitude** :
- Entre deux altitudes : `and altitude >= 1000 and altitude < 2000`
- Sous un seuil d'altitude et au-dessus d'un autre seuil : `and (altitude <= 1000 or altitude > 2000)`
- Filtrer sur la **mortalité** :
- Ne garder que les données de mortalité : `and mortalite = true`
- Exclure les données de mortalité : `and mortalite = false`
- Rechercher un mot ou une expression dans les **commentaires** : `and commentaires like '%mangeoire%'`
- Filtrer sur le **comportement** :
- Rechercher un comportement particulier : `and comportement @> '{"Se nourrit"}'`
- Rechercher plusieurs comportements <u>simultanés</u> : `and comportement @> '{"Se nourrit", "Se déplace"}'`
- Rechercher plusieurs comportements pas forcément simultanés : `and (comportement @> '{"Se nourrit"}' or comportement @> '{"Se déplace"}')`