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NOMBRE='s1';
% Para LucÃa
addpath('C:\Users\lucía\Documents\eeglab14_1_1b')
eeglab;
ppal = 'dirección ppal';
% ppal = '/home/usuario/Dropbox/silabas/DATA/'
%% STEP 1: Run filters
%
filepathIN = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datos\';
filepathOUT = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\filtros\ellip\';
freqname = 256;
% chan = 0; nfig = 200;
EEG = pop_loadset('filename',[NOMBRE,'.set'], 'filepath', filepathIN);
EEG = eeg_checkset( EEG );
% d = fdesign.bandpass('N,F3dB1,F3dB2',10,0.1,100,freqname);
% Hd = design(d,'butter');
%
% fvtool(Hd);
%
% data = EEG.data;
% dataOut = filter(Hd,data);
%
%[EEG,com,b]=pop_eegfiltnew(EEG,0.1,100); % ESTE ES UN POSIBLE FILTRO
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
Wp = [0.1 100]/128; Ws = [0.05 120]/128;
Rp = 1; Rs = 40;
[n,Wp] = ellipord(Wp,Ws,Rp,Rs);
[b,a] = ellip(n,Rp,Rs,Wp);
freqz(b,a);
title(sprintf('n = %d Elliptic Bandpass Filter',n));
figure();
EEGp=EEG.data(1,:);
EEGp=EEGp'; %EEGp=canal 1 del EEG en tiempo
filtEEG=filter(b,a,double(EEGp)); %filtFEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada
FEEG=fft(EEGp); %FEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG
FEEG=abs(FEEG);
filtFEEG=fft(filtEEG); %transfomada de fourier del canal 1 filtrado del EEG
filtFEEG=abs(filtFEEG);
%filtEEG=ifft(filtEEG); %filtEEG= canal 1 del EEG en tiempo filtrado
subplot(4,1,1);
plot(EEGp); %grafico canal 1 del EEG
title('canal 1 del EEG en tiempo sin filtro');
subplot(4,1,2);
plot(filtEEG);
title('canal 1 del EEG en tiempo con filtro');
subplot(4,1,3);
plot(FEEG);
title('transformada de fourier del canal 1 del EEG sin filtro');
subplot(4,1,4);
plot(filtFEEG);
title('transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada');
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%mucho ripple
% Wp = [0.1 100]/128; Ws = [0.05 120]/128;
% Rp = 1; Rs = 40;
% [n,Wp] = buttord(Wp,Ws,Rp,Rs);
% [b,a] = butter(n,Wp);
% freqz(b,a);
% title(sprintf('n = %d Elliptic Bandpass Filter',n));
% figure();
% subplot(4,1,1);
% EEGp=EEG.data(1,:);
% EEGp=EEGp'; %EEGp=canal 1 del EEG en tiempo
% plot(EEGp); %grafico canal 1 del EEG
% title('canal 1 del EEG en tiempo sin filtro');
% FEEG=fft(EEGp); %FEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG
% FEEG=abs(FEEG);
% filtFEEG=filter(b,a,FEEG); %filtFEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada
% filtEEG=ifft(filtFEEG); %filtEEG= canal 1 del EEG en tiempo filtrado
% subplot(4,1,2);
% plot(filtEEG);
% title('canal 1 del EEG en tiempo con filtro');
% subplot(4,1,3);
% plot(FEEG);
% title('transformada de fourier del canal 1 del EEG sin filtro');
% subplot(4,1,4);
% plot(filtFEEG);
% title('transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada');
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%decrece muy lento
% Wp = [0.1 100]/128; Ws = [0.05 120]/128;
% Rp = 1; Rs = 40;
% [n,Wp] = cheb1ord(Wp,Ws,Rp,Rs);
% [b,a] = cheby1(n,Rp,Wp);
% freqz(b,a);
% title(sprintf('n = %d Elliptic Bandpass Filter',n));
% figure();
% subplot(4,1,1);
% EEGp=EEG.data(1,:);
% EEGp=EEGp'; %EEGp=canal 1 del EEG en tiempo
% plot(EEGp); %grafico canal 1 del EEG
% title('canal 1 del EEG en tiempo sin filtro');
% FEEG=fft(EEGp); %FEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG
% FEEG=abs(FEEG);
% filtFEEG=filter(b,a,FEEG); %filtFEEG=transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada
% filtEEG=ifft(filtFEEG); %filtEEG= canal 1 del EEG en tiempo filtrado
% subplot(4,1,2);
% plot(filtEEG);
% title('canal 1 del EEG en tiempo con filtro');
% subplot(4,1,3);
% plot(FEEG);
% title('transformada de fourier del canal 1 del EEG sin filtro');
% subplot(4,1,4);
% plot(filtFEEG);
% title('transformada de fourier del canal 1 del EEG filtrada');
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%tarda mucho en caer
chan=0;
nfig=1;
% z_periodogram(double(EEG.data),EEG.srate,chan,nfig,'b')
% legend('Raw data',...
% 'HighPass',...
% 'LowPass',...
% 'Location','NorthEast')
% EEG.data = data;
% tiempos = EEG.times;
% save dataset
%EEG = pop_saveset( EEG, 'filename',[NOMBRE,'_filt.set'], 'filepath', filepathOUT);
%EEG = eeg_checkset( EEG );
%% STEP 2: Clean AC
filepathIN = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\F100\';
filepathOUT = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\F50\';
sujname=NOMBRE;
% EEG = pop_loadset( 'filename', [sujname,'_',freqname,'_filt.set'],...
EEG = pop_loadset( 'filename', [sujname,'_filt.set'],'filepath', filepathIN);
EEG = eeg_checkset( EEG );
matriz = EEG.data;
F_LINE = 50;
Fs = EEG.srate;
data = cleanAC(matriz, F_LINE, Fs);
EEG.data = data;
EEG = pop_saveset( EEG, 'filename', [sujname,'_',freqname,'_filt_AC.set'], 'filepath', filepathOUT);
EEG = eeg_checkset( EEG );
%% STEP3: INTERPOLACION
badchannels = buscaChanIntLucia(sujname);
filepathIN = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\F50\';
filepathOUT = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\Interp\';
% load dataset
filename = [sujname,'_',freqname,'_filt_AC'];
EEG = pop_loadset('filename', [filename,'.set'], 'filepath', filepathIN);
EEG = eeg_checkset( EEG );
% Interpolate bad channels (selected by visual inspection)
if isempty(badchannels)
str = [sujname,': No need to interpolate'];
else
str = [sujname,': Interpolate: '];
for i=1:length(badchannels);
str = [str,EEG.chanlocs(badchannels(i)).labels,' (',num2str(badchannels(i)),'), '];
end
EEG = eeg_interp(EEG, badchannels, 'spherical'); % method = 'invdist' is also the default if nargin<3;
EEG = eeg_checkset(EEG);
end
disp(str)
% Save temporal set...
savename = [filename,'_int'];
EEG = pop_saveset(EEG, 'filename', [savename,'.set'], 'filepath', filepathOUT);
EEG = eeg_checkset( EEG );
%% step 4: ICA
%
% filepathIN = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\Interp\';
% filepathOUT = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\FICA\';
%
% % load dataset
% filename = [sujname,'_',freqname,'_int'];
% EEG = pop_loadset('filename', [filename,'.set'], 'filepath', filepathIN);
% EEG = eeg_checkset( EEG );
%
% EEG = pop_runica(EEG, 'interupt','on');
% EEG = eeg_checkset( EEG );
%
% savename = [sujname,'_ICA','.set'];
% EEG = pop_saveset( EEG, 'filename', savename, 'filepath', filepathOUT);
% EEG = eeg_checkset( EEG );
% %% step 5: Saca ICA
%
% quehacer = 'rej';
%
% filepathIN = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datos';
% filepathOUT = 'C:\Users\lucía\Dropbox\datosFiltrados\ICA';
%
% % load dataset
% filename = [sujname,'_ICA.set'];
% EEG = pop_loadset('filename', filename, 'filepath', filepathIN);
% EEG = eeg_checkset( EEG );
%
% EEG = pop_selectcomps(EEG, [1:30] );
% EEG = eeg_checkset( EEG );
% if strcmp(quehacer,'rej')
% EEG = pop_subcomp( EEG);
% end
% savename = [sujname,'_ICA_removed','.set'];
% EEG = pop_saveset( EEG, 'filename', savename, 'filepath', filepathOUT);
% EEG = eeg_checkset( EEG );