关于pFind结果文件pFind.spectra中Specificity的疑问

[daimantianxingguangzhishi]

根据说明，pFind.spectra文件表头中Specificity列应为：0: non-specific; 1: C端特异性酶切; 2: N端特异性酶切; 3:两端都特异性酶切。我们发现我们样品得到的结果文件pFind.spectra似乎不符合上述取值规律：样品elastase酶切（酶切位点是AVSGLI的C端），搜库参数为Non-Specific，在pFind_Filtered.spectra、pFind.protein文件中所有肽段的Specificity均为0（non-specific），但pFind.spectra文件共27677个PSM中，却显示存在Specificity为1的肽段252个（例如：A.YRRFYGPV.-、R.RFYGPV.-、K.EQPPQPLFSFDFGA.S；其中两个间隔符“.”之间的为匹配的PSM，前后各为DataBase中蛋白被匹配段前后的氨基酸），Specificity为2的肽段289个（例如：G.APGVPGPA.G、-.MGPQGAR.R、M.GEGPVGEPPPL.Q）。尽管这些肽段全部因为q value>0.01而被筛去，以Non-Specific为搜库参数时是否应该所有肽段的Specificity都为0？