diff --git a/Makefile b/Makefile
index 5544c3f..82f0494 100644
--- a/Makefile
+++ b/Makefile
@@ -1,6 +1,5 @@
 CXX=g++
 DEBUG?=0
-CXXFLAGS?=-c
 LDFLAGS=-pthread
 LDLIBS=-lrt
 ifneq ($(OS), Windows_NT)
@@ -32,7 +31,7 @@ $(EXECUTABLE):$(OBJECTS)
 	$(CXX) $(LDFLAGS) $(OBJECTS) -o $@ $(LDLIBS)
 
 .cpp.o:
-	$(CXX) $(CXXFLAGS) $< -o $@
+	$(CXX) $(CXXFLAGS) -c $< -o $@
 
 $(SRC)/main.o: $(SRC)/parameter.h $(SRC)/matrix.h $(SRC)/fastq.h $(SRC)/common.h
 $(SRC)/parameter.o: $(SRC)/parameter.h $(SRC)/fastq.h $(SRC)/common.h