docker.md

• Docker Windows
  • Configurações gerais
    • Erro de não estar no docker-users
    • Mudando o drive do Docker logo depois de instalar
    • Reduzindo uso de memória do processo vmmem
  • Operações gerais
    • Copiando arquivo de/para container
    • Instalando bibliotecas novas em imagem puxada pronta do Dockerhub sem editar o Dockerfile
  • Containers
    • PostGIS
    • Jupyter Notebook
    • R

Docker Windows

Configurações gerais

Erro de não estar no docker-users

• Fonte: https://avidosguy.wordpress.com/2019/10/10/solved-you-are-not-allowed-to-use-docker-you-must-be-in-the-docker-users-group/

• Iniciar > computer management > local users and groups > groups > docker users > botão direito > adicionar ao grupo > digitar nome de usuário e verificar, dar ok

Mudando o drive do Docker logo depois de instalar

• Fonte: https://stackoverflow.com/a/63752264

• Mudando para a pasta D:\Docker\wsl\data

  wsl --list -v
  wsl --export docker-desktop-data "D:\Docker\wsl\data\docker-desktop-data.tar"
  wsl --unregister docker-desktop-data
  wsl --import docker-desktop-data "D:\Docker\wsl\data" "D:\Docker\wsl\data\docker-desktop-data.tar" --version 2
  del "D:\Docker\wsl\data\docker-desktop-data.tar"
  

Reduzindo uso de memória do processo vmmem

• Fonte: https://dev.to/tallesl/vmmen-process-consuming-too-much-memory-docker-desktop-273p

• Criar arquivo C:\Users\<username>\.wslconfig:\

  [wsl2]
  processors=1
  memory=1GB
  

Operações gerais

Copiando arquivo de/para container

• Fonte: https://jtemporal.com/copying-files-into-a-container/

• Arquivo dados.csv para a pasta /home/jovyan/work/ dentro do container relaxed_hypatia

  docker cp dados.csv relaxed_hypatia:/home/jovyan/work/dados.csv
  

Instalando bibliotecas novas em imagem puxada pronta do Dockerhub sem editar o Dockerfile

• Fonte: https://bobcares.com/blog/edit-docker-image/ (2. Create a modified image)

• Com o container rodando, pega nome e roda:

  docker exec -it container-name bash
  

• Instalar bibliotecas que estão faltando (no caso abaixo, geopandas e dependências dentro do scipy-notebook)

  conda install pandas fiona shapely pyproj rtree
  pip install geopandas
  pip install psycopg2
  pip install GeoAlchemy2
  pip install openpyxl
  

• Instalar bibliotecas faltando no r-notebook

  conda install -c r r-ggplot2
  conda install -c conda-forge r-rgdal
  

• Sair do bash e salvar mudanças no container, depois de pegar seu ID por docker container ls

  exit
  docker commit container-ID image-name
  

Containers

PostGIS

• Fonte: https://www.alexurquhart.com/post/set-up-postgis-with-docker/

• Instalando

  docker volume create pg_data`
  docker run --name=postgis -d -e POSTGRES_USER=user -e POSTGRES_PASS=password -e POSTGRES_DBNAME=gis -e ALLOW_IP_RANGE=0.0.0.0/0 -p 5432:5432 -v pg_data:/var/lib/postgresql --restart=always kartoza/postgis:13
  

• Adicionando extensão SFCGAL no QGIS > DB Manager > SQL Window com a base acima já conectada

  CREATE EXTENSION postgis_sfcgal;
  

Jupyter Notebook

• Fontes:

  • https://hub.docker.com/r/jupyter/scipy-notebook
  • https://github.com/jupyter/docker-stacks

• Rodando no diretório G:\

  docker run -p 8888:8888 -v "G:/":/home/jovyan/work jupyter/scipy-notebook
  

R

• Fonte:
• https://hub.docker.com/r/jupyter/r-notebook

docker run -p 8787:8888 -v "G:/":/home/jovyan/work jupyter/r-notebook