-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 68
New issue
Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.
By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.
Already on GitHub? Sign in to your account
Adding MPI test #518
base: main
Are you sure you want to change the base?
Adding MPI test #518
Changes from all commits
File filter
Filter by extension
Conversations
Jump to
Diff view
Diff view
There are no files selected for viewing
Original file line number | Diff line number | Diff line change | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
@@ -0,0 +1,61 @@ | ||||||||||||||||||||||||||
using MPI | ||||||||||||||||||||||||||
using Enzyme | ||||||||||||||||||||||||||
using Test | ||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||
struct Context | ||||||||||||||||||||||||||
x::Vector{Float64} | ||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||
function halo(context) | ||||||||||||||||||||||||||
x = context.x | ||||||||||||||||||||||||||
np = MPI.Comm_size(MPI.COMM_WORLD) | ||||||||||||||||||||||||||
rank = MPI.Comm_rank(MPI.COMM_WORLD) | ||||||||||||||||||||||||||
requests = Vector{MPI.Request}() | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != 0 | ||||||||||||||||||||||||||
buf = @view x[1:1] | ||||||||||||||||||||||||||
push!(requests, MPI.Isend(x[2:2], MPI.COMM_WORLD; dest=rank-1, tag=0)) | ||||||||||||||||||||||||||
push!(requests, MPI.Irecv!(buf, MPI.COMM_WORLD; source=rank-1, tag=0)) | ||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != np-1 | ||||||||||||||||||||||||||
buf = @view x[end:end] | ||||||||||||||||||||||||||
push!(requests, MPI.Isend(x[end-1:end-1], MPI.COMM_WORLD; dest=rank+1, tag=0)) | ||||||||||||||||||||||||||
push!(requests, MPI.Irecv!(buf, MPI.COMM_WORLD; source=rank+1, tag=0)) | ||||||||||||||||||||||||||
Comment on lines
+19
to
+22
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
for request in requests | ||||||||||||||||||||||||||
MPI.Wait(request) | ||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
return nothing | ||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||
MPI.Init() | ||||||||||||||||||||||||||
np = MPI.Comm_size(MPI.COMM_WORLD) | ||||||||||||||||||||||||||
rank = MPI.Comm_rank(MPI.COMM_WORLD) | ||||||||||||||||||||||||||
n = np*10 | ||||||||||||||||||||||||||
n1 = Int(round(rank / np * (n+np))) - rank | ||||||||||||||||||||||||||
n2 = Int(round((rank + 1) / np * (n+np))) - rank | ||||||||||||||||||||||||||
nl = rank == 0 ? n1+1 : n1 | ||||||||||||||||||||||||||
nr = rank == np-1 ? n2-1 : n2 | ||||||||||||||||||||||||||
nlocal = nr-nl+1 | ||||||||||||||||||||||||||
Comment on lines
+33
to
+38
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||||
context = Context(zeros(nlocal)) | ||||||||||||||||||||||||||
fill!(context.x, Float64(rank)) | ||||||||||||||||||||||||||
halo(context) | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != 0 | ||||||||||||||||||||||||||
@test context.x[1] == Float64(rank-1) | ||||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != np-1 | ||||||||||||||||||||||||||
@test context.x[end] == Float64(rank+1) | ||||||||||||||||||||||||||
Comment on lines
+45
to
+46
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||
dcontext = Context(zeros(nlocal)) | ||||||||||||||||||||||||||
fill!(dcontext.x, Float64(rank)) | ||||||||||||||||||||||||||
autodiff(Reverse, halo, Duplicated(context, dcontext)) | ||||||||||||||||||||||||||
MPI.Barrier(MPI.COMM_WORLD) | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != 0 | ||||||||||||||||||||||||||
@test dcontext.x[2] == Float64(rank + rank - 1) | ||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
if rank != np-1 | ||||||||||||||||||||||||||
@test dcontext.x[end-1] == Float64(rank + rank + 1) | ||||||||||||||||||||||||||
Comment on lines
+56
to
+57
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||||
if !isinteractive() | ||||||||||||||||||||||||||
MPI.Finalize() | ||||||||||||||||||||||||||
end |
Original file line number | Diff line number | Diff line change | ||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
@@ -10,6 +10,7 @@ using Aqua | |||||||||||||||||||||||
using Statistics | ||||||||||||||||||||||||
using LinearAlgebra | ||||||||||||||||||||||||
using InlineStrings | ||||||||||||||||||||||||
using MPI | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
using Enzyme_jll | ||||||||||||||||||||||||
@info "Testing against" Enzyme_jll.libEnzyme | ||||||||||||||||||||||||
|
@@ -1176,7 +1177,7 @@ end | |||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
bias = Float32[0.0;;;] | ||||||||||||||||||||||||
res = Enzyme.autodiff(Reverse, f, Active, Active(x[1]), Const(bias)) | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
@test bias[1][1] ≈ 0.0 | ||||||||||||||||||||||||
@test res[1][1] ≈ cos(x[1]) | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
@@ -1585,7 +1586,7 @@ end | |||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
@inline function myquantile(v::AbstractVector, p::Real; alpha) | ||||||||||||||||||||||||
n = length(v) | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
m = 1.0 + p * (1.0 - alpha - 1.0) | ||||||||||||||||||||||||
aleph = n*p + oftype(p, m) | ||||||||||||||||||||||||
j = clamp(trunc(Int, aleph), 1, n-1) | ||||||||||||||||||||||||
michel2323 marked this conversation as resolved.
Show resolved
Hide resolved
|
||||||||||||||||||||||||
|
@@ -1598,7 +1599,7 @@ end | |||||||||||||||||||||||
a = @inbounds v[j] | ||||||||||||||||||||||||
b = @inbounds v[j + 1] | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
return a + γ*(b-a) | ||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
|
@@ -1820,18 +1821,18 @@ end | |||||||||||||||||||||||
@test 1.0 ≈ Enzyme.autodiff(Forward, inactive_gen, Duplicated(1E4, 1.0))[1] | ||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
function whocallsmorethan30args(R) | ||||||||||||||||||||||||
temp = diag(R) | ||||||||||||||||||||||||
R_inv = [temp[1] 0. 0. 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. temp[2] 0. 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. temp[3] 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. 0. temp[4] 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. 0. 0. temp[5] 0.; | ||||||||||||||||||||||||
temp = diag(R) | ||||||||||||||||||||||||
R_inv = [temp[1] 0. 0. 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. temp[2] 0. 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. temp[3] 0. 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. 0. temp[4] 0. 0.; | ||||||||||||||||||||||||
0. 0. 0. 0. temp[5] 0.; | ||||||||||||||||||||||||
] | ||||||||||||||||||||||||
Comment on lines
+1825
to
1830
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
return sum(R_inv) | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
R = zeros(6,6) | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
R = zeros(6,6) | ||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
dR = zeros(6, 6) | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
@static if VERSION ≥ v"1.11-" | ||||||||||||||||||||||||
|
@@ -2719,7 +2720,7 @@ end | |||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
# TODO: Add test for NoShadowException | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
function indirectfltret(a)::DataType | ||||||||||||||||||||||||
a[] *= 2 | ||||||||||||||||||||||||
return Float64 | ||||||||||||||||||||||||
|
@@ -3419,6 +3420,22 @@ end | |||||||||||||||||||||||
) | ||||||||||||||||||||||||
@test ad_eta[1] ≈ 0.0 | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
@testset "MPI" begin | ||||||||||||||||||||||||
testdir = @__DIR__ | ||||||||||||||||||||||||
# Test parsing | ||||||||||||||||||||||||
mpi_test = false | ||||||||||||||||||||||||
try | ||||||||||||||||||||||||
include("mpi.jl") | ||||||||||||||||||||||||
mpiexec() do cmd | ||||||||||||||||||||||||
run(`$cmd -n 2 $(Base.julia_cmd()) --project=$testdir $testdir/mpi.jl`) | ||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
mpi_test = true | ||||||||||||||||||||||||
catch | ||||||||||||||||||||||||
mpi_test = false | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
@test mpi_test | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
There was a problem hiding this comment. Choose a reason for hiding this commentThe reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more. [JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶
Suggested change
|
||||||||||||||||||||||||
function absset(out, x) | ||||||||||||||||||||||||
@inbounds out[1] = (x,) | ||||||||||||||||||||||||
|
@@ -3698,10 +3715,10 @@ end | |||||||||||||||||||||||
Duplicated(inters, dinters), | ||||||||||||||||||||||||
) | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
@test dinters[1].k ≈ 0.1 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[1].t0 ≈ 1.0 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[2].k ≈ 0.3 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[2].t0 ≈ 2.0 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[1].k ≈ 0.1 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[1].t0 ≈ 1.0 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[2].k ≈ 0.3 | ||||||||||||||||||||||||
@test dinters[2].t0 ≈ 2.0 | ||||||||||||||||||||||||
end | ||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||
@testset "Statistics" begin | ||||||||||||||||||||||||
|
There was a problem hiding this comment.
Choose a reason for hiding this comment
The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.
[JuliaFormatter] reported by reviewdog 🐶