本模板基于现有的中山大学研究生学位论文模板(感谢@1FCENdoge!)，在其基础上做了一点点微调，以更符合生科院的要求。 与这一模板相比，本模板的主要调整详见针对生科院要求的主要微调内容和其他添加的内容和功能。 本人已经使用该模板完成硕士学位论文，并通过学院的格式检查。 如果存在任何问题，欢迎提出 issue。
本模板目前在 Linux 环境下已经进行测试，Windows 用户如果通过 Powershell/CMD 编译可能需要安装 sed 命令（更推荐在 WSL 环境下进行编译）。
本模板需要使用 TeX Live(>=2017) 进行编译，建议使用 make 工具进行编译：
make pdf # 编译生成论文 main.pdf (会自动执行 clean 命令)
make clean # 删除编译过程中生成的临时文件
根据生科院扉页模板重新绘制了论文扉页。
生科院提供的扉页模板使用 Word 的文档网络进行排版，本模板没有忠实的进行还原，而是大致的模拟了其效果。但是我看了一些其他同学和往年的研究生论文，这方面都参差不齐
针对生科院要求调整了封面格式，主要改动为：
- 调整字号
- 标题名称只包括内容
- "摘要"/"ABSTRACT" 左对齐而不是居中对齐
生科院要求所有图表必须有中英文图表注释。
这里引入 bicaption 宏包来解决。
一些复杂的图表还有添加更详细的图表注释的需求，例如说明图片中不同子图的详细信息，说明图片中不同元素以及颜色的含义。 这些内容不应该出现在论文开端的图表目录中，同时在正文中也需要与图表的主标题进行区分（例如主标题使用粗体，同时两个部分应该有所间隔）
这里定义了 bicaptionX 命令，包装了一个较为简单的实现：
% 不需要添加注释的情况
\bicaptionX{中文标题}{English Title}
% 添加注释的情况
\bicaptionX{中文标题}{English Title}{注释}
其具体效果如下：
如果对这一实现不够满意，也可以参考 bicaption 的宏包文档进行自定义。
在常见的英文参考文献格式中，物种名称通常用斜体表示。
对应到 bib 文件中，物种名称会用 \emph{} 的环境扩起来，并在 biblatex 编译后最终得到正确的表示。
而在 GB/T 7714-2015 的官方文件中，没有明确看到这一要求。
模板使用了 GB/T 7714-2015 BibTeX Style 项目提供的官方 bibstyle，在这一 bst 文件下 \emph{} 环境会被处理成下划线而不是斜体。
因此多一事不如少一事其实是我比较菜不会改bst，添加了一个自动检测并替换 \emph 的简单 sed 命令去掉所有的物种名斜体环境，并在使用 make pdf 编译文档时自动执行。
也可以只在最开始执行一次 sed 命令修改 reference.bib ，之后都可以正常编译：
sed -i "s/\\\emph{/{/g" reference.bib或者打开 reference.bib 文件，手动去除所有 \emph 字段。
- 符号说明放到了附录中。
为了方便绘制 PCR 反应的热力学条件，本模板借鉴了相关讨论包装了一个函数。
函数包括两个参数，前面一个参数为默认参数，控制绘制的 PCR 图的大小，默认为 0.4；后面一个参数为描述 PCR 反应条件的序列:
\drawPCR[比例]{反应序列}序列由一系列的 PCR 反应条件组成，反应条件间由逗号分隔。每个反应条件包括三个值：反应温度、反应时间、是否绘制虚线区分不同的循环（用0和1表示）。例如一个常规的 PCR 反应可以使用 “94.0/3:00/0,98.0/0:10/1,62.0/1:00/0,68.0/5:00/0,68.0/10:00/1,4.0/
其绘制效果如下图所示:
为了尽可能的偷懒节省精力，本模板还引入了 csvsimple 包用于自动将表格转换为三线表。
如果对表格的效果没有过多要求，可以直接使用如下代码，简单的用 csv 直接获得一个三线表。
\begin{table}
\csvautobooktabular{table/asterids.csv}
\end{table}- 支持 R 代码渲染
- 支持 shell 代码渲染
- 提供 DNA/蛋白 序列的显示函数，支持针对不同核苷酸/氨基酸字符自动上色
画饼长期计划，欢迎合作：
- 使用 quarto/Rmarkdown 直接编译毕业论文，整合数据处理、图片绘制和文字排版
- 使用 typst 编译毕业论文，获得更好的编译速度
- 和其它研究生论文模板合并，构建跨学院的统一模板
- 感谢@1FCENdoge 提供了一个全面的论文模板，使得在其基础上可以比较轻松的进行调整以符合要求