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camillemonchicourt committed Aug 22, 2024
1 parent 397781f commit 7a03fbe
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35 changes: 15 additions & 20 deletions docs/manuel-utilisateur.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,20 +1,18 @@
# MANUEL UTILISATEUR

Par \@DonovanMaillard

## Généralités : gérer la taxonomie avec TaxHub

L'application TaxHub permet de gérer les informations liées à la
taxonomie dans votre instance de GeoNature : espèces saisissables sur le
module Occtax de GeoNature, informations diverses sur les espèces,
enrichissement des fiches espèces de GeoNature-Atlas, regroupement des
enrichissement des fiches espèces de GeoNature-atlas, regroupement des
taxons en listes personnalisées etc.

3 onglets principaux structurent l'application :

- **TAXREF** : Dans cet onglet, tout utilisateur connecté ou non peut
explorer le référentiel taxonomique. Un utilisateur disposant des
droits suffisants pourra également ajouter des attributs ou médias à un taxon.
permissions suffisantss pourra également ajouter des attributs ou médias à un taxon.
- **LISTES** : Cet onglet recense les listes disponibles et permet d'en
créer des nouvelles, de les peupler, les modifier et les exporter.
- **ATTRIBUTS** : Cet onglet recense les attributs disponibles et permet d'en
Expand All @@ -30,7 +28,7 @@ connecté.

![image](images/explore_taxref.gif)

Cet onglet permet d'explorer le référentiel taxonomique national et de consultrer pour chaque taxon les attributs et médias propre à votre instance.
Cet onglet permet d'explorer le référentiel taxonomique national et de consultrer pour chaque taxon les attributs et médias de votre instance.

![image](images/detail_taxon.gif)

Expand All @@ -39,17 +37,17 @@ Cet onglet permet d'explorer le référentiel taxonomique national et de consult

Ainsi, les taxons peuvent se voir attribuer un certain nombre
d'informations, nommées "attributs", et être classés dans des listes
personnalisées, sans lien obligatoire avec la taxonomie.
personnalisées.

Afin d'attribuer des informations à un taxon, il faut l'éditer (bouton "crayon" depuis
l'onglet Taxons ou directement depuis l'onglet Taxref), et renseigner
Afin d'attribuer des informations à un taxon, il faut l'éditer (bouton "crayon"
depuis l'onglet Taxref), et renseigner
les différents attributs qui concernent l'espèce.

De la même manière, vous pourrez intégrer ce taxon à des "listes"
personnalisées. Un taxon peut appartenir à plusieurs listes. Enfin, vous
pourrez associer un ou plusieurs médias à un taxon. Ces médias peuvent
être des images, des vidéos, des enregistrements sonores, des fichiers
pdf etc.
PDF etc.


## Créer et gérer des listes personnalisées
Expand All @@ -58,23 +56,21 @@ TaxHub permet d'organiser les taxons au sein de listes personnalisées.
Ces listes peuvent répondre à tous types de besoins : espèces invasives,
espèces ciblées par un programme d'étude, espèces saisissables dans un
module, espèces jugées douteuses dans la base de données de votre
organisme etc. Seules les taxons ajoutés à votre instance (donc
disponibles dans l'onglet "taxons") peuvent être ajoutées à des
listes.
organisme etc.

Pour consulter les listes existantes, vous devez aller dans l'onglet
"listes". Vous y verrez et pourrez explorer les listes disponibles
(bouton "oeil"), ainsi que les exporter au format csv.

Avec les droits nécessaires, vous pourrez éditer les informations
relatives à vos listes. Vous pourrez également associer à la liste en
question de nouvelles entités parmi les taxons de votre instance (bouton
question de nouvelles entités parmi les taxons de votre instance depuis un fichier CSV de cd_nom (bouton
"peupler").

Enfin, vous pouvez créer de nouvelles listes en renseignant les
informations relatives à celles-ci (id, nom, description, éventuellement
règne ou Groupe2 INPN associé, ainsi qu'un éventuel pictogramme). Dans
ce cas, seules des espèces du règne ou du groupe pourront peupler la
informations relatives à celles-ci (nom, description, éventuellement
règne ou Groupe 2 INPN associé). Dans
ce cas, seules des taxons du règne ou du groupe pourront peupler la
liste en question. Ces restrictions évitent, par exemple, de peupler une
liste 'insectes pollinisateurs' avec des taxons qui autres que des
insectes.
Expand All @@ -98,15 +94,14 @@ listes rouges. Un nouveau sera créé pour intégrer une notion d'actions
:

Afin d'ajouter et ordonner des thèmes, il faut créer une nouvelle
entrée dans la table `bib_themes` du schéma `taxonomie`. En créant cette
entité, un rang peut être donné au nouveau thème afin de les ordonner
entrée dans l'onglet "Thème". En créant cette
entité, un ordre peut être donné au nouveau thème afin de les ordonner
dans l'interface.

![image](images/create_theme.gif)

De la même manière, pour créer un attribut, il faut créer une nouvelle
entrée dans la table `bib_attributs`, également dans le schéma
`taxonomie`. Il est alors possible de définir ses modalités possibles
entrée dans l'onglet "Attribut"`. Il est alors possible de définir ses modalités possibles
(type et valeurs), de l'ordonner et de lui attribuer un thème. Comme
pour les listes, les attributs peuvent ou non être limités à un règne ou
à un groupe 2 INPN.
Expand Down

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