Skip to content

ippras/utca

Repository files navigation

UTCA

Программа условно разделена на 4 составляющие.

Configuration

Calculation

Введенные конфигурационные данные нормализуются.

Для расчета значений столбцов 1,2/2,3-DAG и 2-MAG можно выбрать один из двух источников данных: Experimental или Calculation. По умолчанию - Experimental.

  • Experimental - значения получаются нормализацией данных соответствующего столбца.

  • Calculation - значения расчитываются по соответствующим взаимобратным формулам:

    • 1,2/2,3-DAG = (3 * 1,2,3-TAG + 2-MAG) / 4
    • 2-MAG = 4 * 1,2/2,3-DAG - 3 * 1,2,3-TAG12

Для расчета значений столбца 1,3-DAG также можно выбрать один из двух источников данных: 1,2/2,3-DAG или 2-MAG. По умолчанию - 1,2/2,3-DAG.

Значения расчитываются по соответствующим формулам:

  • 1,3-DAG = 3 * 1,2,3-TAG - 2 * 1,2/2,3-DAG3
  • 1,3-DAG = (3 * 1,2,3-TAG - 2-MAG) / 245

Settings

Параметр Normalization может быть установлен в один из трех вариантов: Mass, Molar или Pchelkin.

  • Mass - нормализация данных не учитывает поправку на молярную массу ионов. Нормализация осуществляется по формуле: s/∑(s), где s - плошадь пика соответствующего иона.
  • Molar - нормализация данных учитывает поправку на молярную массу ионов. Нормализация осуществляется по формуле: (s * m)/∑(s * m), где s - плошадь пика, а m - масса соответствующего иона.
  • Pchelkin - соотношение данных учитывает поправку на молярную массу ионов. Отношение осуществляется по формуле: s / ∑(s * m / 10), где s - плошадь пика, а m - масса соответствующего иона. Это отношение не является нормализующим.

Параметр Signedness может быть установлен в один из двух вариантов: Signed, Unsigned. По умолчанию - Signed.

При расчете 2-MAG с установленным параметром Calculation могут получится отриательные значения, что корректно с математической точки зрения, но не корректно с физической точки зрения. В таких случаях требуется установка параметра в значение Unsigned, чтобы отрицательные значения преобразовавались в нулевые.

Программа Пчелкина:

  • 1,2/2,3-DAG: Experimental
  • 2-MAG: Calculation
  • 1,3-DAG: 1,2/2,3-DAG
  • Normalization: Pchelkin
  • Signedness: Unsigned

Composition

Полученные при расчетах данные компонуются.

Settings

Visualization

Полученные при композиции данные представляются в графическом виде.

Footnotes

  1. [S]₂ = 4[S]₁₂ – 3[S]₁₂₃: DOI 10.1023/a:1016732708350, page 706, formula 1

  2. MEC(I) = 4 * MAL(I) - 3 * MBL(I): Fortran program PIN341.for, page 56

  3. MED(I) = 3 * MBL(I) - 2 * MAL(I): Fortran program PIN341.for, page 68

  4. [a]₁₃ = 3[a]₁₂₃ − [a]₂ × 2⁻¹: DOI 10.1023/a:1016732708350, page 706, formula 6

  5. [a]₁₃ = 3[a]₁₂₃ − [a]₂ × 2⁻¹: DOI 10.1007/s11746-014-2553-8, page 2056

About

Ultimate TAG Calculation Application

Topics

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published