Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

ручка /v1/compound #7

Merged
merged 5 commits into from
Jul 16, 2021
Merged

ручка /v1/compound #7

merged 5 commits into from
Jul 16, 2021

Conversation

vvrubel
Copy link
Owner

@vvrubel vvrubel commented Jul 10, 2021

пока черновой вариант ручки /v1/compound
Представляет собой поиск молекул по подструктуре. Возвращает списком все данные из базы.
Параметры:
smiles – подструктура, по которой делать поиск в базе;
skip – сколько документов пропустить от 0-го наблюдения;
limit – сколько документов выдать на один запрос.

обращаю внимание, что из ~1250 строк кода ~1070 – это файл poetry.lock

@vvrubel vvrubel requested a review from churnikov July 10, 2021 12:50
@@ -29,6 +29,7 @@ importlib = "^1.0.4"
importlib-metadata = "^1.6.1"
python-dotenv = "^0.18.0"
click = "^8.0.1"
jupyter = "^1.0.0"
Copy link
Collaborator

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Ой, а зачем это он тебе?
У тебя же даже в репе ноутбуков нет

Copy link
Owner Author

Choose a reason for hiding this comment

The reason will be displayed to describe this comment to others. Learn more.

Ой, а зачем это он тебе?

У тебя же даже в репе ноутбуков нет

Ну они в .gitignore )))0) я просто хотела пару дней назад через них запускать все эти mongo-rdkit операции - как раз тогда ничего не получилось, но сейчас (без юпитера) все вроде работает из того, что есть. У меня кст вопрос: а субструктуры рандомные или может есть "список избранных подструктур", хотя вряд ли. Как вар можно Серёжу спросить, что ему покажется интересным (просто совсем дичь неправдоподобную спрашивать не хочется, тк было бы интересно соотнести химическую логику в конце работы)

@vvrubel vvrubel merged commit 5ef87b7 into master Jul 16, 2021
@vvrubel vvrubel deleted the mongo-rdkit branch August 8, 2021 12:05
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
None yet
Projects
None yet
Development

Successfully merging this pull request may close these issues.

None yet

2 participants