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自动化偏倚风险评估 (Automated Risk of Bias Assessment)

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xi102/RoB_SystemReview

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自动化偏倚风险评估系统

项目说明

这是一个自动化偏倚风险评估(Automated Risk of Bias Assessment)的演示

用Flask和Jinja2随便糊了个前端和后端

训练数据集是自己爬的Cochrane的文章,搜刮了一些随机对照试验(Randomized Controlled Trial, RCT)的文章构建了一点数据集,用BERT炼的丹

功能及界面演示

image-20210120124842340

登陆后首页

选择上传文件界面(多个文件)

评估结果显示界面

运行和调试

准备训练好的模型

如果自己训练了一份就把data/model里面的文件替换掉就好了

训练好的模型我放到data/model里面一份,由于TF-IDF那个模型的文件太大了,我放到release里面了

curl --create-dirs -O --output-dir ./data/model https://github.com/xi102/RoB_SystemReview/releases/download/v0.1.0/TF-IDF_vectors_model.m

修改相关配置

配置基本都直接扔在Start.py里面了

记得自行配置数据库

安装依赖

pip install -r requerements.txt

运行调试

python Start.py

请勿将此命令用于生产环境,默认设置开启Debug模式、端口5000,生产环境请自行关闭Debug并设置防火墙策略

各目录功能

├── data
│   ├── model
│   ├── Processed_txt
│   ├── Txt_pre
│   └── Upload_pdf
├── dataProcess
│   ├── pdfProcess.py
│   ├── predict.py
│   ├── __pycache__
│   └── test.py
├── Form.py
├── LICENSE
├── Model.py
├── __pycache__
│   ├── Form.cpython-38.pyc
│   └── Model.cpython-38.pyc
├── README.md
├── Start.py
├── static
│   ├── css
│   └── img
└── templates
    ├── form_base.html
    ├── login.html
    ├── pre_result.html
    ├── register.html
    └── upload.html

data:存放相关文章和训练模型数据 dataProcess:文章处理和训练预测 static:css、js等静态资源 templates: 前端html等

关于

本项目相关文章

夏渊.系统评价中自动化偏倚风险评估的相关算法研究[D].四川:电子科技大学,2020.
基于 BERT 的自动化偏倚风险评价方法的研究

历史

2019-2020寒假,润润在做。我划水围观。

2020-2~2020-6 疫情在家,搞别的项目。润润被困湖北,我强势围观。

2020-7~2020-12 遗留骗钱项目,润润在湖北赶上疫情做了一半毕业跑路修福报去了,无人接手

2021-1 我将遗留的各版本整理成git仓库并放到github上了(以102网吧的名义)

2020-1 修了一点前端的小问题,调整一下Flask项目的目录结构,将python3.5和一堆老依赖依赖升到python3.8,相应的库(比如pdfminer)升到最新。

添加文档和注释,调整版本号

(python 3.9 改动比较大,像scikit-learn等库最高支持到3.8,暂时升不上去)

关于本仓库

整理了一下乱糟糟的公用工作站准备重装上面要停止维护的Ubuntu 16.04 LTS,清理归档各路祖传屎山和文件。陆续放出各路祖传代码和历史文物,这是其中之一。

这些祖传屎山基本都没怎么有注释和文档,也没有git或者svn之类的版本控制,包括这个。

image-20210120133539293

这个已经算非常好的了,还有

还能跑的都尽力写了点文档并把依赖环境和运行方法附上了。

大多数项目的质量都达不到生产环境的要求,请勿直接用于生产环境!

初步整理于 2021年1月 ,未完待续

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