setup: Muda instrucoes

content/01_setup.qmd

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 # Organizando Ambiente para Análise
 
-Primeiro, é necessário criar e ativar um ambiente Conda que contenha todas as ferramentas necessárias para os próximos passos. Caso ainda não tenha o Conda instalado, siga as instruções [neste link](link para instalar o conda).
+Primeiro, é necessário criar e ativar um ambiente Conda que contenha todas as ferramentas necessárias para os próximos passos.
+Caso ainda não tenha o Conda instalado, siga as instruções [neste link](link para instalar o conda).
+
+Vá até [este link](https://github.com/dalmolingroup/MEDUSA/blob/main/environment.yml) para adquirir o arquivo `environment.yml`.
 
 ```bash
-$ conda env create -f medusaPipeline.yml
-$ conda activate medusaPipeline
+conda env create -f environment.yml
+conda activate medusaPipeline
 ```
 
-
 A estrutura de diretórios a seguir ajudará na organização dos arquivos baixados, arquivos intermediários e seus outputs:
 
 ```bash
-$ mkdir -p ./Pipeline/{result,data/{merged,assembled,collapsed,removal/{index,reference},raw,trimmed},alignment/{db,index},taxonomic/db,functional/db}
-```
+mkdir -p ./Pipeline/{result,data/{merged,assembled,collapsed,removal/{index,reference},raw,trimmed},alignment/{db,index},taxonomic/db,functional/db}
+```