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20181227
Manabu ISHII edited this page Jan 9, 2019
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今回は、東京のみ開催です。また、いつもと違い会場が、国立情報学研究所(NII)です。
趣旨：ワークフローシステム、再現性、自動化、アノテーション、自然言語処理、画像処理、AIの利用など、関連する様々な事柄について、知見を交換したり、技術を高めるための研究会です
日程：2018年12月27日木曜日
時間：10時から19時
インターネット環境：eduroamが利用可能です。eduroam アカウントがない方には、当日ゲストアカウントを発行します。
東京会場：国立情報学研究所（19階）
1901会議室、部屋の前に、10:00-19:00 Workflow Meetupと書いてある看板があるかもしれません。
アクセス：国立情報学研究所（学術総合センター）
| 時間 | 内容 | 備考 |
|---|---|---|
| 10:00-11:30 | 作業 | |
| 11:30-12:30 | 昼食 | まわりがこみそうなので、とりあえずこの時間に設定しました |
| 12:30-13:30 | 作業 | |
| 14:00-15:00 | 作業 | |
| 15:00-15:30 | 中間報告、問題点共有 | |
| 15:30-17:00 | 作業 | |
| 18:00-19:00 | まとめ |
- Rootless Docker daemon で、CWLが動くのか
- Yacleの実装(CWLのGolang実装)
- 少なくとも１つは、conformance_test を読む。
- Galaxy から、前回作ったCWLを呼び出せることを確認する
- ワークフローシステム(CWLとかNextflowなど)の紹介スライドの作成
-
一手詰めワークフローをなにかのシステムで実装
- Galaxyでの、CWLサポートについて可能であればサポートを広げる
- Galaxy多言語対応
- Nextflow と kubernetes、参考
- ACE EditorでのCWLのシンタックスハイライトの作成
- これはpull requestがきた。
- ご自身で開発中のシステムを含めて、CWLやNextflowなどワークフローシステムを使っているところや、使っている情報があれば知りたいです
- Nextflowの Kubernetes サポートについてどうやっているのかなど
- uDockerの中身、具体的な挙動
- Azure Batchや、AWS Batchなどを使ったジョブ実行方式について調べたいと思っています。dockerコンテナつかえるのかなど。
- セキュリティ関連
- 下記のシステムなど使用(開発)経験はあるので、そのあたりは応えられるかもしれません。
- Puppet, Ansible, Chef, Jenkins
- Java, Python
- Galaxy, CWL
- 各種エディタでの、言語ハイライト
- 当日やることを書く、複数あれば複数書く
- こんなこと知りたい、調査したいということを書く。複数あれば複数書く
- なにかその他の情報など、自分が詳しい分野とか、まわりへの告知など
#WorkflowDevMeetup