DWI_GE
El resonador GE Discovery MR750 recientemente recibió una actualización de software a versión 29.1 (2022), lo que incluyó importantes mejoras para DWI.
Una de las principales mejoras es la capacidad de incorporar protocolos DWI multi-shell sin necesidad de realizar cada shell como una adquisición independiente. La otra buenísima es la posibilidad de adquirir múltiples rebanadas de forma simultánea (SMS; Hyperband), con lo que el tiempo de adquisición se reduce de manera lineal en función del número de rebanadas simultáneas.
Para adquirir DWI multi-shell, se debe seleccionar la opción Tensor, y escribir el número de direcciones totales (la suma de todas las direcciones en todos los shells), y como bvalue escribir el máximo valor de b en nuestras shells.
El sistema incluye algunos protocolos famosos pre-cargados. Para utilizarlos, vamos a la pestaña Advanced y en Tensor filename ponemos el número entero que corresponde a un archivo llamado Tensor????.dat que está grabado en la carpeta /usr/g/bin del resonador.
En caso de querer colocar nuestros propios archivos de protocolos multishell, los pondremos en esa ruta, con la ayuda del físico médico de la URM. Los archivos pueden consultarse aquí y se resumen a continuación:
| protocolo | archivo | nDirs en consola | bval en consola | nb0 | b1 | dirs1 | b2 | dirs2 | b3 | dirs3 | b4 | dirs4 | Notas |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HCP | tensor1090.dat | 90 | 2000 | 0 | 1000 | 45 | 2000 | 45 | Especificar nb0 en consola | ||||
| ADNI-3 | tensor1127.dat | 126 | 2000 | 6 | 500 | 6 | 1000 | 48 | 2000 | 60 | Recomendado para gradientes >70 mT/m | ||
| ADNI-3 | tensor1127.dat | 100 | 2000 | 9 | 500 | 6 | 1000 | 38 | 2000 | 47 | Recomendado para gradientes menos poderosos | ||
| ABCD | tensor4321.dat | 102 | 3000 | 6 | 500 | 6 | 1000 | 15 | 2000 | 15 | 3000 | 60 | |
| ABCD | tensor4321.dat | 96 | 3000 | 0 | 500 | 6 | 1000 | 15 | 2000 | 15 | 3000 | 60 | Especificar nb0 en consola |
| UK Biobank | tensor521.dat | 104 | 2000 | 4 | 1000 | 50 | 2000 | 50 | |||||
| UK Biobank | tensor521.dat | 6 | 2000 | 3 | 2000 | 3 | Para revpe | ||||||
| Desconocido | tensor8313.dat | 296 | 3000 | 26 | 1000 | 90 | 2000 | 90 | 3000 | 90 | |||
| Desconocido | tensor8313.dat | 270 | 3000 | 0 | 1000 | 90 | 2000 | 90 | 3000 | 90 | Especificar nb0 en consola |
El manual de usuario del software del resonador GE está disponible aquí. Se recomienda revisar página 1807.
Hay más explicaciones y scripts para generar nuestros propios archivos tensor????.dat en este fabuloso link.
Para evitar que se interpolen las imágenes en el plano (no bueno para dwidenoise), usar CV rhmethod=1.
Para cambiar la polaridad del phase encoding para poder usar eddy y topup, usar revpe.